由于鹅口疮的病因和发病机制基本明确，白色念球菌是一种真菌，属于机会性细菌，目前主要是对症治疗。
临床中主要遵循早期发现和加强护理、治疗措施个体化等原则，对鹅口疮患者进行原发病治疗和药物治疗。
一、药物治疗
1、鹅口疮的局部用药：
（1）制霉菌素：可将外用制霉菌素片500000U溶于500ml生理盐水中漱口，或局部用制霉菌素混悬液或制霉菌素锭剂。
（2）碳酸氢钠：可给予1%~4%碳酸氢钠溶液漱口，碳酸氢钠溶液呈弱碱性，其可改变口腔酸碱度，消除残留的凝乳或糖类，而使口腔环境保持或变为碱性，以抑制霉菌生长。
（3）0.05%甲紫水溶液：外用，可用于白色念珠菌引起的口腔炎，治疗鹅口疮时只在患处涂药，如将溶液咽下可致食管炎、喉头炎。
（4）唑类抗真菌药：局部用克霉唑锭剂、咪康唑、克霉唑、氟康唑、伊曲康唑、泊沙康唑等含漱液。
2、鹅口疮的系统用药：鹅口疮全身治疗的抗真菌药物主要是三唑类、多烯类、棘白菌素类。
（1）三唑类抗真菌药物：唑类抗真菌药物分为咪唑类和三唑类抗真菌药物，其作用都与抑制真菌体内麦角固醇的合成有关，进而破坏真菌细胞膜的完整性而达到抗真菌的作用。
咪唑类常见的有克霉唑、酮康唑、咪康唑、联苯苄唑，三唑类常见的有氟康唑、伊曲康唑、泊沙康唑、伏立康唑。
三唑类抗真菌药生物利用度高、作用强，毒副反应尤其是肝脏毒性相对较小。
对氟康唑难以控制者推荐伊曲康唑或泊沙康唑，对其他药物治疗无效的病例，推荐使用伏立康唑。
（2）多烯类抗真菌药物：如制霉菌素或两性霉素B，通过与麦角固醇结合，引起细胞膜多方面改变，至细胞溶解、坏死。
目前制霉菌素常作为局部用药，而两性霉素B因毒性较大，临床可使用其脂质体制剂，以降低毒副反应，推荐其用于难治性病例。
（3）棘白菌素类抗真菌药物：如卡泊芬净、米卡芬净、阿尼芬净等，通过抑制丝状真菌和酵母菌细胞壁的(1-3)-β-D-葡聚糖的合成而杀灭真菌，因人体细胞无细胞壁，因此此类药毒性较小。
对于顽固或复发性病例，可选择静脉使用棘白菌素类抗真菌药物。
二、中医治疗
1、心脾郁热型：对于患有口腔黏膜布满白屑，白屑周围红晕较甚，伴心烦、口渴、面赤、口臭、大便干结、小便短赤、舌尖红、苔黄的患者，常用手法如下：
（1）清脾经200次，清心经加至500次；
（2）推下七节骨300次；
（3）按揉心俞、脾俞各1分钟。
2、脾虚湿盛型：对于患有口腔黏膜布满白屑，周围红晕色淡，伴面色白、身体瘦弱、四肢欠温、口唇色淡、大便溏薄、小便清长、舌质淡、苔白腻的患者，常用手法如下：
（1）摩中脘5分钟；
（2）补脾经300次，揉板门加至100次；
（3）按揉脾俞、胃俞穴各1分钟；
（4）按揉足三里穴1分钟。
三、其他治疗
支持疗法主要是加强口腔护理和饮食营养，提高自身抵抗力，补充维生素类，主要是维生素B族，饮食中要有足够的营养和热量。
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