羌羌虫病潜伏期4-21d，一般为10-14d。起病快，体温快速升高，可在1-2d内达39-40岁以上，多为放松热型，偶有寒战或寒战，常伴有头痛、全身疼痛、食欲不振等症状。体征可包括面部和颈部、胸部发红、结膜充血、焦痂或溃疡淋巴结肿大、皮疹、肝脾肿大等。病程进入第二周后，病情往往恶化。
神经系统的表现可能是神经冷漠、重听、妄想，甚至抽搐或昏迷，以及脑膜刺激征；循环系统可表现为心率快、心音弱、心率紊乱等心肌炎；呼吸系统可表现为咳嗽、气短、胸痛、肺罗音等肺炎。少数人可能有广泛的出血现象。
第三周后，患者体温逐渐下降到正常，症状减少到消失，并逐渐恢复。但如果不及时得到有效的病原体治疗，一些患者就会死于严重的疾病。中国南北地区流行的羌虫病东方植物毒性不同。南方夏季羌虫病临床表现较重，北方秋冬表现较轻。
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