肛瘘引起的原因，是由于肛门周围脓肿发生了自行溃破，或者是在进行人为切开排脓以后，遗留了管道和外口。 肛瘘和肛周脓肿是属于同一个疾病的两个发展过程，肛瘘一般通过肛门局部的检查，可以初步明确诊断，必要时可以进行直肠内的超声检查，或者是肛周核磁共振的检查，进一步判断肛瘘的瘘管走形，以及原发感染内口的位置。
肛瘘在诊断明确以后需要通过手术进行治疗。
如果是低位单纯性的肛瘘，可以直接切除原发的感染内口，肛瘘的管道部分和外口，如果是高位复杂性的肛瘘，需要采用挂线的手术方式，保护肛门括约肌，降低术后发生肛门失禁的风险。
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