目前还没有针对西尼罗河病毒感染的特殊治疗药物。目前的治疗主要是对症治疗和支持治疗。
轻度患者有限，但脑炎患者需要积极治疗，常用措施如下。
一般治疗
卧床休息，尽量避免不必要的刺激。保持呼吸道畅通，昏迷患者注意定期翻身、拍背、吸痰、吸氧，防止褥疮。注意精神、意识、生命体征和瞳孔的变化。给予足够的营养和维生素，保持水和电解质的平衡。
对症治疗
高烧者以物理降温为主，冰帽降温是首选，酒精浴放冰袋；药物降温为辅，可选择安痛定、柴胡、消炎痛栓。
脑水肿或脑疝引起的脱水剂应立即治疗，可使用20％；甘露醇快速静滴；必要时应及时吸痰，保持呼吸道通畅。
镇静剂治疗：稳定成人10-20 mg/次，小儿0.1-0.3 mg/kg/次，肌肉注射，必要时静脉缓注，但不超过10 mg；
水合氯醛成人1.5-2.0 g儿童50 /次mg/kg/次(每次不超过1 g），鼻饲或保留灌肠；苯巴比妥钠成人100 mg/次，肌肉注射。
甘露醇的用量与上述相同。
快尿、高渗葡萄糖可辅助脱水治疗。
糖皮质激素可减轻脑水肿，短期使用。
常规氧疗；
洛贝林、可拉明、利他林等静脉滴注呼吸兴奋剂；必要时，气管插管、气管切开，及时机械通风。
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