第20名「青叶茂」
他是NERV总部中央作战司令部副操作员，阶级为中尉，通常担任通信以及情报分述等任务。
第19名「冬月耕造」
NERV的副司令，常常在碇源堂不在的时候代理他的工作。于2003年加入GEHIRN，成为源堂的左右手。
第18名「铃原冬二」
碇真嗣的同学，同时也是第四适格者，非常关心自己的妹妹，最初因为真嗣驾驶的初号机在战斗中造成的破坏导致妹妹受伤而对真嗣恶言相向甚至抱以拳脚，后来在了解了真嗣的感受后消除了成见，两人成为非常好的朋友。
第17名「日向诚」
在新世纪福音战士中是总部机关的联络员，为人机敏胆大，是一副小弟弟的形象，擅长电脑操作，对上司葛城美里很是钦慕。不过在细节尚不够检点，曾偷过伊吹的资料，侵入过保安部的电脑。平日最大的爱好是看漫画书。
第16名「根府川先生」
第15名「赤木直子」
NERV创始人之一，是本作中的一个悲剧角色。她爱上了碇源堂，可是碇源堂内心只有妻子碇唯，直子只不过是被他利用，在绫波丽（1#）的刺激下（当然这是受到碇源堂的指使）扼杀了她，最后含恨自杀而终。
第14名「铃原樱」
碇真嗣的同班同学铃原东治的妹妹。
第13名「碇源堂」
NERV的指挥官，NERV是联合国指挥下的一个虚构的研究与开发和准军事组织。
第12名「赤木律子」
NERV本部技术开发部技术一课首席人员，EVA开发计划实际的负责人，超级计算机MAGI开发者赤木直子和赤木雄的女儿。性格冷静、实事求是，烟抽得很凶，是个工作狂。是一个相当有才能的科学家，个性属于理智型，处事果决而明快，常带有一种现实主义式的冷漠无情。
第11名「绫波唯」
作为一位优秀的生物工程学者参与了EVA初号机的开发，并成为第一位驾驶员，后在启动试验中被初号机吸收。丈夫是碇源堂，两人育有一子碇真嗣。
第10名「伊吹摩耶」
NERV本部技术局一课所属，阶级二尉，直属上司是赤木律子，负责监视EVA同步率并收集分析与EVA相关的资料。是一个清秀乖巧的女孩，对上司兼学姐律子抱有喜欢的感情，在补完之际看到的是自己和律子紧紧相拥的景象。
第9名「真希波·玛丽·伊兰崔亚斯」
真希波是EVA适格者，驾驶EVA战斗时会唱着歌，是个留着双马尾的乐天派眼镜妹。
第8名「加持良治」
特殊监察部所属，也是日本政府内务省调查部的间谍，是位受女性欢迎的角色，其人生观亦多次引导碇真嗣重新建立战斗意志，是个令人钦佩的家伙。
第7名「式波・明日香・兰格雷」【剧场版】
在《福音战士新剧场版》中，姓氏“惣流”变更为式波。在故事中，明日香是一个14岁的天才美少女，驾驶EVA贰号机抗击使徒。
第6名「碇真嗣」
真嗣是一个14岁的少年，被父亲碇源堂召唤到第3新东京市，驾驶巨大人型兵器EVA初号机，与不断来袭的被称为“使徒”的神秘敌人战斗。
第5名「Penpen」
美里饲养的宠物企鹅，经过基因改造，不仅可以适应第三新东京市的环境和温度，而且十分聪明，喜好洗热水澡，居住在一个类似于冰箱的房间中。
第4名「惣流·明日香·兰格雷」
在故事中，明日香是一个14岁的天才美少女，驾驶EVA贰号机抗击使徒。
第3名「葛城美里」
她在NERV的任务包括指挥及监视EVA驾驶员、构思及发布攻击策略，与赤木律子协调EVA技术支援及测试也是她的工作，她同时也是碇真嗣与惣流·明日香·兰格雷的监护人。
第2名「渚薰」
在原版电视动画中，渚薰仅出场一集，他是EVA驾驶员，登场不久便成功打开主角碇真嗣闭塞的心灵。
第1名「绫波丽」
绫波丽是一名沉默寡言的14岁少女，驾驶着EVA试作零号机对抗使徒。
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