上海交通大学医学院附属瑞金医院建于1907年，原名广慈医院，是一所三级甲等大型综合性教学医院。
医院占地面积12万平方米，建筑面积24.5万平方米，绿化面积4万平方米，核定床位1600张，全院职工3445人，其中医师1010余人（其中正副教授及各类高级科技人员593人）。
拥有中国科学院院士陈竺、中国工程院院士王振义、陈赛娟等一大批在国内外享有较高知名度的医学专家。医院设有34个临床科室、9个医技科室；现有国家教育部重点学科3个（内分泌、血液、消化），上海市重中之重学科1个（血液），上海市重点学科1个（内分泌），上海市优势学科一个（肾脏），上海市教委重点学科6个（消化外科、血液科、内分泌科、骨科、烧伤科、心脏内科），上海市卫生局医学领先专业重点学科3个（消化外科、血液科、肾脏内科）。
复旦大学附属中山医院建于1937年，是卫生部部属综合性教学医院。医院占地面积95892.1㎡，总建筑面积326149㎡，核定床位1700张。2011年门急诊就诊量277万人次，出院病人7.5万人次，住院手术病人4.9万人次。
全院职工3090人，有中国科学院院士1人，中国工程院院士2人，高级职称370人，医师1114人（含住院医师规范化培训基地205人），护士1205人，医技人员380人。
医院设有除儿科以外的所有科室、综合实力雄厚。心脏、肝癌、肾脏和肺部疾病诊治是医院的重点和特色，诊治水平始终处于国内领先地位。
国家临床重点专科13个：消化科、检验科、麻醉科、心血管内科、内分泌科、胸外科、心脏大血管外科、临床护理、中医脑病科、呼吸内科、肾病科、普通外科和重症医学科。
复旦大学附属华山医院创建于1907年，是复旦大学附属综合性教学医院和中国红十字会直属医院。华山医院有核定床位1216张，全院每年门急诊就诊病人150余万人次，住院病人2万余人次，其中有50％左右是由全国各地转来的各种疑难杂症，尤其是神经内外科、手外科及皮肤科比例更高。华山医院医疗技术力量雄厚，全院2000余名职工之中，医疗专业技术人员占80％，其中副高职以上专家300多人，中国科学院和中国工程院院士各1名。在全国学术性机构任主任委员或副主任委员13人，在上海学术性机构任主任委员或副主任委员28人。
全院共设39个临床医技科室，是一个特色学科很多的医院，尤以神经内外科、皮肤科、手外科、中西医结合、传染病科、脊柱和关节外科、肾脏病科、泌尿外科、肾移植、胰腺外科、乳房外科、内分泌科、职业病和风湿科、颌面外科、影像医学和核医学、运动医学、康复医学为特长，其中神经外科、手外科、中西医结合科、泌尿外科、神经内科、传染病学和抗生素、肾病科、心血管科、影像医学和核医学、普外科为国家级重点学科，临床神经医学、手外科为上海市领先学科，神经外科、手外科被命名为上海市临床医学中心。
第二军医大学附属长海医院创建于1949年，是一所集医疗、教学、科研为一体的现代化大型综合性医院。1993年首批评为三级甲等医院。医院占地32万平方米，建筑面积27.6万平方米，其中工作用房17.6万平方米，生活用房10万平方米。医院设有科室49个，展开床位1800余张。
拥有一批国内外知名的专家教授和中青年技术骨干。医院现有博士点25个、硕士点40个，并设博士后流动站4个。
60年代以来先后形成肝胆外科、胸心外科、烧伤外科、创伤外科、血液内科、消化内科等特色学科。
目前拥有国家级重点学科15个，全军专科研究所、中心13个，全军重点实验室2个，上海市临床医学中心2个，上海市医学质控中心3个，上海市示范学科1个，现为全军、全国临床药理基地。
上海交通大学医学院附属仁济医院建于1844年，是上海开埠后第一所西医医院。医院目前由东西南北四个院区和上海市肿瘤研究所组成，是一个学科门类齐全，集医疗、教学、科研于一体的综合性三级甲等医院。
东院位于浦东陆家嘴金融贸易区内，于1999年10月建成投入使用，占地86875m2，建筑面积206859 m2；西院位于黄浦区中央商务区内，毗邻外滩，占地7811 m2，建筑面积31959 m2；在建中的南院位于闵行区浦江镇，紧邻世博家园，占地68497 m2，建筑面积82590 m2；在建中的北院位于巨野路灵山路，占地6667 m2，建筑面积17350 m2；肿瘤所位于斜土路，总建筑面积7523 m2，由肿瘤流行病学研究室、癌基因与相关基因国家重点实验室、及十三个课题组组成。医院东、西两个院区目前总核定床位1400张。
截止2011年底，医院共有在编职工2831人，其中正、副高级职称专家367名；博导40名、硕导115名。
医院设有42个临床医技科室：消化科、心内科、血液科、风湿病科、老年病科、呼吸科、肾脏科、神经内科、内分泌科、肿瘤科、康复科、急诊科、核医学科、放射诊疗科、泌尿科、普外科、骨科、心血管外科、胸外科、血管外科、神经外科、肝脏外科、整形外科、麻醉科、中医科、儿科、眼科、妇产科、生殖医学科、耳鼻咽喉-头颈外科、皮肤科、感染科、口腔科、营养科、放射科、超声医学科、病理科、检验科、药剂科、输血科、内科门诊、健康保健中心。
心血管病排名： 复旦大学附属中山医院（全国第三）、上海交通大学医学院附属瑞金医院。
复旦大学附属中山医院血管外科研究所对血管外科疾病治疗的年门诊量、手术量最大，治疗病种最全，经典手术与微创治疗并重，集临床、科研、教学于一体，为医学界和病人公认的权威医疗单位。
年门诊量12000人次/年，其中专家门诊5000人次/年，核定床位20张，实际开放床位30张，住院人数800人次/年，外省市病人约占住院患者的65％，疑难病例占50％，危重病例占30％，手术700例/年，是国内最早开展动脉疾病的腔内微创手术单位之一，专科手术种类和数量位居国内之首。
上海交通大学附属瑞金医院心血管内科于1954年由我国著名心血管病专家陶清、龚兰生等著名教授创办1996年成为上海市教委重点学科。
1999年被批准为卫生部心血管临床药理基地，近3年负责或参加了17项国际国内多中心临床研究，是国家教委确定的首批博士授予点，现有博士生导师3名，硕士生导师7名，心血管内科现有医师34名，其中终身教授1人，教授8人，副教授10人，主治医师11人；其中博士14人 ，硕士14人，主管技师5名，护理人员36名。
瑞金医院心血管科包括了临床、冠心病介入、起搏电生理、心脏超声、心电图室、心磁图室、心血管生化及分子生物学实验室和卫生部临床药理基地等部门，拥有心脏专科病床100张，每年专科门诊约85000名人次，出院约2300人次，病种齐全，可保证开展药物临床试验的病人来源。
拥有国内外几乎所有心血管临床仪器及设备，能开展各种成人心脏血管疾病的诊断、治疗技术。
该科室在冠心病的介入治疗、电生理检查、射频消融术、起搏器安装术、难治性心力衰竭、高脂血症的个体化治疗和其他复杂、疑难心血管病的诊断、治疗方面在国内处领先地位。
每年开展冠状动脉经皮成形术(PTCA)及支架术、二尖瓣球囊扩张术等介入诊断和治疗1500余例，为全国领先医院之一。
妇产科排名：复旦大学附属妇产科医院（全国第二） 、上海交通大学医学院附属仁济医院。
复旦大学附属妇产科医院为全国首家妇产科专科医院，前身西门妇孺医院是由美国人玛格丽特·威廉逊（Margaret.Wiillianson）于1884年6月创建的教会医院。
产科的技术力量雄厚，组建了一支以母胎医学为核心的强大的学术队伍，包括学科带头人李笑天教授、学术骨干严英榴教授、技术骨干程海东教授等。
本专科共有医师106名: 主任医师13名， 副主任医师20名， 主治医师38名， 住院医师35名; 其中博士40名， 硕士42名， 学士25名。博士研究生导师8名，硕士研究生导师18名。本专科共有护理人员178名: 副主任护师1名。主管护师13名， 护师69名， 护士95名，其中硕士研究生导师1名。
目前的主要学科建设方向有高危妊娠和产科处理、产前诊断和胎儿医学，以及出生缺陷一级预防三个方向。
复旦大学附属妇产科医院妇科包括11个病房，门诊包括普通门诊、专家门诊、特色专病门诊、疑难门诊等，其中特色门诊有妇科肿瘤门诊、生殖内分泌门诊、生殖免疫门诊、宫颈病门诊、中西医结合妇科门诊、盆底疾病门诊、围绝经期门诊等。
132人构成了医师梯队，其中研究生学历占75.7%，博导9名，硕导12名。共设学组8个，生殖内分泌学组、妇科肿瘤学组、围绝经期及老年学组、生殖免疫学组、中西医结合妇科学组、辅助生殖学组、盆底及腔镜学组、宫颈疾病及感染学组，相关临床及科研工作均为国内领先，部分工作国际领先。
上海交通大学附属仁济医院妇产科历史悠久，解放后在著名的全国二级教授、妇产科专家郭泉清主任指导下，逐步建立了妇科、产科、计划生育和生殖免疫等三级学科，在国内具有相当高的学术地位和影响力。
科室现有床位数138个，年门急诊人数近15万人次，年收治住院病人近6000人次，抢救重危病人成功率达95%以上。
现有医生42名，其中主任医师8名、副主任医师11名，主治医师17人，其中具有硕士和博士学位的占70.5%。经过数十年的努力，仁济妇产科在妊娠合并症、生殖免疫、妇科肿瘤等方面逐渐形成了自己的优势，在医、教、研各方面均得到了迅速的发展。
肿瘤专科排名：复旦大学附属肿瘤医院 （全国第三）、东方肝胆外科医院、复旦大学附属中山医院。
复旦大学附属肿瘤医院成立于1931年，是国内规模最大、学术力量最雄厚的肿瘤学医教研基地之一。1958年，著名的临床医学家、中国肿瘤内科和化学治疗的主要奠基人之一孙曾一教授率先组建了复旦大学附属肿瘤医院化疗小组。1965 年化疗科正式建立，成为国内最早设立的少数几家肿瘤内科之一。随后，肿瘤内科不断发展壮大，始终保持其在全国领先的地位。肿瘤内科目前有医护人员120余名，医生占35%，护士占65%。其中，教授/主任医师4名，副教授/副主任医师10名，讲师/主治医师/主管护师20余名。
复旦大学附属肿瘤医院的肿瘤妇科是国内最早成立的诊治妇科肿瘤的专业科室，目前共有教授和副教授级医师19名，拥有2个病区100张住院病床和1个妇科治疗室。
科室以临床诊疗和相关研究为主，尤其重视妇科肿瘤的早期诊断，早期治疗，并以综合治疗为特色，对于宫颈癌、卵巢癌、宫体癌、外阴癌、恶性葡萄胎、绒癌、子宫肉瘤、输卵管癌、阴道癌、子宫肌瘤等各种妇科良恶性肿瘤，均按国际规范充分利用手术、放疗、化疗、介入治疗等治疗手段，制定有效的综合方案，已形成了一整套妇癌诊治规范，早期妇癌患者5年生存率达90%以上，各种妇癌的诊治水平均居国内领先地位，部分达到国际水平。
东方肝胆外科医院在原发性肝癌的早期诊断和治疗，中晚期肝癌的综合治疗，原发性肝癌术后抗复发治疗，肿瘤的免疫治疗、介入治疗等方面均居国内外先进水平。不仅采用传统的外科手术治疗方法，还采取了细胞治疗、微波方法、射频方法、氩氦刀方法、激光光敏技术、肝内肿瘤酒精注射疗法和经股动脉至肝动脉插管加栓塞疗法等。东方肝胆外科医院全年门诊量16万余人次，出院2.3万余人次，手术例次7000余人次。
至2011年底，吴孟超院士率领同事们已成功实施肝脏切除术2万余例，胆道手术1万余例，积累了国际上最大宗的肝癌病例库和标本库，手术成功率达98.5%，肝癌术后5年总体生存率53.2%，小肝癌术后5年生存率79.8%。术后生存时间最长的已达46年，患者至今健在。
肝癌切除例数、切除率、生存率等指标均处于国际领先水平。1996 年成功施行肝移植 5 例，最小的病人年仅 9 岁。其中3例均健康生活至今。目前肝移植已成为该院常规治疗方法之一。
复旦大学附属中山医院于1968年成立上海第一医学院中山医院肿瘤小组，1969年正式成立中山医院肝肿瘤小组，并设病房。
1978年改名中山医院肝癌研究室，分为病房和实验室。1988年改名为上海医科大学(现复旦大学)肝癌研究所，是我国最主要的两个肝癌防治研究中心之一。著名肝癌外科专家、工程院院士汤钊猷教授任所长。现有医技人员40余人，其中正、副教授近20人。分为肝肿瘤外科和内科。
拥有80余张专科病床，面积900m2的设备精良的实验室。
外科以治疗为主，内外科、中西医、基础与临床结合，配有超声刀、氩氦刀、多普勒B超诊断仪等设备，肝癌早诊早治、不能切除肝癌的缩小后切除，肝癌术后复发的手术再切除、冷冻、综合治疗，4000余例肝癌诊疗经验，5年生存率达60－70％，112例生存10年以上。
内科配有血细胞分离机、射频治疗仪、超声诊断治疗仪 ，微波、无水酒精、介入、及生物治疗等特色项目。
神经外科排名：复旦大学附属华山医院（全国第二）、上海交通大学医学院附属仁济医院、第二军医大学附属长海医院。
复旦大学附属华山医院神经外科是我国南方最早建立的神经外科，经过几代人半个多世纪的艰苦创业和辛勤工作，科室的学术地位一直都走在全国的前列。目前是博士点、博士后流动工作站、WHO神经科学研究与培训中心、教育部国家重点学科、“211工程”重点学科。
目前已经拥有病床600张，现代化的专业手术室25间以及开展神经外科诊疗所需的全部设备，包括术中核磁共振导航、Cyberknife、伽玛刀、PET/CT、3D血管造影机、神经导航、计算机虚拟现实手术计划系统等国际一流的硬件设施。全方位地开展了微侵袭神经外科、脑脊髓肿瘤和血管性疾病、颅脑创伤、功能神经外科和细胞分子神经外科等的临床研究，并实现了手术、放疗、化疗和功能康复的综合式服务。
上海交通大学附属仁济医院自1956年创建神经外科以来， 经过半个世纪几代神经外科人的不懈努力，神经外科在医疗、教学、科研、学科建设和人才培养等方面都取得长足进步。
目前神经外科拥有神经外科医师29名，其中教授6名、副教授11名。
博士导师4名、硕士导师6名。
60%神经外科医师拥有医学博士学位。
神经外科设置床位110张。
拥有一批国内外知名神经外科专家，临床医疗经验丰富、能完成各类神经外科疾病的诊断和治疗。
特别是在颅脑创伤基础研究和临床诊治、脑肿瘤显微外科技术和微创技术、脑血管疾病诊治、癫痫诊断和治疗、颈椎疾病和颅神经疾病的显微外科手术等方面积累了丰富的临床经验、居国内先进水平。
目前神经外科年门急诊达2万人次、年住院病人2000多人次、年手术1200多台次、年血管内介入诊断和治疗400例多次。
第二军医大学附属长海医院神经外科建科于1953年，是上海最早设立神经外科医院之一，目前已建设成为全国重点学科，全军脑血管病中心，上海市脑血病临床中心，神经外科硕士、博士点，第二军医大学博士后工作站。现有主任医师、正教授6名，副主任医师、副教授４名，主治医师１０名。
长海医院神经外科以脑血管病、颅底肿瘤、鞍区肿瘤诊治及功能神经外科为专业特色，年手术量2500余例次，治疗范围包括颅内动脉瘤、血管狭窄、脑血管畸形、脑胶质瘤、脑膜瘤、垂体瘤、听神经瘤、三叉神经痛和面肌痉挛、颅咽管瘤、椎管肿瘤、帕金森病、特发性震颤、强迫症、癫痫、及颅颈交界畸形、蛛网膜囊肿、脑积水、颅脑外伤等。
皮肤科排名：复旦大学附属华山医院（全国第一）、上海交通大学医学院附属瑞金医院、上海交通大学医学院附属新华医院。
复旦大学附属华山医院皮肤科在国内外享有较高的声誉和较大的影响，门诊就诊人数逐年上升，2008全年门诊超过100万人次，单科年门诊量世界第一。其中约60％来自外省市， 港、澳、台地区及其他国家来诊者亦与日俱增。病例数之多、病种之广在国内是首屈一指，在国际上亦属罕见。
现有开放病床33张，收治各种疑难杂症和危重病人，并设急诊24小时值班制，皮肤科向社会承诺全年无休，自年初一至年三十，每天都有门诊。为提高医疗质量，配合各研究室、组的科研工作，现开设十多种专 病门诊，包括结缔组织病、遗传性皮肤病、化妆品皮炎、银屑病、白癜风、光感性皮肤病、异位性皮炎、真菌病、脱发等。
上海交通大学附属瑞金医院灼伤整形科经过多年的探索，成功地创立以瑞金烧伤补液公式、混核移植方法、冬眠疗法等为特色的大面积烧伤救治方法，被誉为“中国方法”。
46年来已收治烧伤病人2万余例，其中成功救治三度烧伤面积90%以上病人6例（1例烧伤总面积达100%，III度94%），居世界领先水平，已成为以大面积烧伤救治为特色的烧伤中心。
目前年门诊量在48000人次左右，年出院病人超过900人次左右，总治愈率保持在98.8%左右。
瑞金医院烧伤整形科和上海市烧伤研究所现有正高职称10名、副高职称9名、中级职称22名。
上海交通大学附属新华医院皮肤科由我国皮肤病性病学奠基人之一的杨天籁教授于1958年所创建，是我国儿童皮肤病学的开创单位，集医、教、研于一体，诊疗技术先进、治疗手段齐全，以儿童皮肤病诊疗为特色，兼顾儿童与成人发展的大型综合性皮肤病专科。2011年科室全年门急诊总量达3１万人次。
新华医院皮肤科2008年成为国家药物临床试验基地，2009年成为上海交通大学医学院“遗传性皮肤病诊疗中心”，2010年成为中华医学会皮肤性病学分会“特应性皮炎研究中心”。
2012年列入国家临床重点专科建设项目。
目前皮肤科有医师２２名，其中主任医师2名，博士生导师１人，硕士生导师１人。8２%的医师具有硕士或博士学位。科内设有成人门诊、儿童门诊、性病门诊、激光美容门诊、皮肤科病房、皮肤病理室、真菌室、性病实验室、过敏原检查室、手术室、光疗和光动力治疗室、激光和冷冻室、中药治疗室。
内分泌科排名：上海交通大学医学院附属瑞金医院（全国第一）、上海交通大学医学院附属第六人民医院 、复旦大学附属华山医院、复旦大学附属中山医院。
上海交通大学附属瑞金医院内分泌代谢病科成立于上世纪50年代，经过50余年来的不断发展，已成为国内最重要的内分泌代谢病基础和临床研究基地。科室现有床位60张，在编医师24位。其中终身教授2人、教授5人，副教授4人。
该学科在糖尿病的基础和临床研究方面居国内前列，在糖尿病诊治、慢性并发症的诊治、糖尿病自我监护和糖尿病宣教方面形成特色，在胰岛素抵抗、2型糖尿病，IGT，肥胖，异常脂血症、原发性高血压和冠心病中的作用做许多卓有成效的工作，曾获上海市科技进步3等奖和首届瑞金医疗成果2等奖。
近年，科室致力于肥胖、骨质疏松等疾病的临床和基础研究，在诊断和治疗方面取得大量成果，是国内最早开展这方面系统研究的单位之一。
“以病人为中心，不断提高医疗质量”是内分泌代谢科的宗旨。同时还建立了糖尿病及其并发症的检测指标。
在国内较早建立了无创性的糖尿病神经功能测定室，可从神经诱发电位、感觉神经、心脏自主神经和胃肠自主神经多方位，对糖尿病神经病变做出诊断，提高了糖尿病神经并发症的诊断能力，并形成一系列有效的治疗方法。
上海市第六人民医院内分泌代谢科的上海市糖尿病临床医学中心是一个集临床、科研、教学为一体的综合性机构，也是上海市糖尿病研究所、上海市糖尿病重点实验室、国家重点学科、上海市教委重点学科。是上海交通大学医学院内分泌专业硕士点及博士点。
该学科是国内较早开展糖尿病基础和临床研究的单位，是我国糖尿病分子病因学的发源地之一，亦是我国糖尿病研究领域成果最多、内容最丰富的单位，亦是公认的国内著名、国际知名的糖尿病研究、诊治中心。
中心现有各级人员39人，其中院士1人、正高职称（教授）8人、副高职称9人、中级职称15人、初级职称及其他人员7人。目前拥有博士生导师5人、硕士生导师6人。
近年来，中心始终以糖尿病、肥胖和代谢综合征为主攻方向，站在糖尿病及其相关疾病临床医学科学的前沿，围绕内分泌系统的常见病、多发病，积极发展亚学科和交叉学科，逐渐形成了一个以糖尿病为中心，包含糖尿病分型诊断、遗传咨询、个体化教育、营养咨询、运动计划、高危人群防治、糖尿病足病、糖尿病眼病、糖尿病肾病、妊娠糖尿病防治、糖尿病神经血管病变筛查治疗、肥胖和代谢综合征等10余个亚学科并建立了“糖尿病多学科联合诊治”平台和中心化诊治模式，近年更是开创了“糖尿病医院-社区一体化无缝管理”全新模式，使中心与二级医院、社区服务中心联动，糖尿病患者得到全面高效的管理和随访，大幅度提高了达标率，该模式已被卫生部在全国三十多个省市推广。
复旦大学附属华山医院内分泌科是国内最早成立的内分泌专科之一。
华山医院内分泌科一贯坚持“特色立科、创新兴科、人才强科”的发展战略，良好保持科室各项医疗业务的全面发展，形成了总体实力有较大提高，特色项目特色鲜明的格局，其中糖尿病慢性并发症和神经内分泌疾病诊治两大主要特色发展方向已初具规模，联合华山医院神经外科、神经内科、神经病理、放射科、核医学科、肾脏内科等国家教育部重点学科相关科室2004年成立了“复旦大学内分泌糖尿病研究所”。
现有终身教授1名，资深教授2名，在职教授4名，副教授8名，主治医师及住院医师15名。
复旦大学附属中山医院内分泌科于1989年4月成立中山医院糖尿病并发症防治中心，复旦大学内分泌－糖尿病研究所中山医院研究室。现有教授3名，副教授及副主任医师5名，主治医师6名。其中博士生导师2名，硕士生导师3名。拥有床位30张，对内分泌常见疾病和少见疾病的诊治有丰富的诊疗经验。糖尿病急性并发症抢救成功率高。对肾上腺疾病、垂体病变、尿崩症、内分泌高血压、性腺发育不全、代谢性骨病和甲状旁腺肿瘤，胰腺内分泌肿瘤、胰岛素抵抗－卵巢疾病进行鉴别诊断和治疗。
糖尿病并发症中心成立于2001年，重点开展糖尿病的诊断、防治工作，对糖尿病各种并发症早期筛查和综合治疗。例如：早期诊断糖尿病合并动脉粥样硬化，冠心病，外周血管病，脑血管病变和高血压，糖尿病肾脏病变，糖尿病视网膜病变等。尤其擅于对糖尿病血管病变，科室开展中西医结合的治疗方法，获得上海市科学技术发展基金的资助。
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