抗菌药物治疗失败最常见的原因是选择药物不当，引起感染的病原体对所使用的抗生素有耐药性，随着抗生素在临床上的广泛使用以至于滥用，越来越多的病原体对经常使用的抗生素产生了耐药性，凭经验用药有时候不能保证所选择的抗生素对病原体敏感，还需要通过做细菌培养和药敏实验来选择敏感的抗生素。
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