遗传因素使某些儿童具有惊厥易感性，在各种环境因素的促发下产生脑炎后遗症发作。
对此，北京黎明医院专家提醒：要特别强调遗传咨询的重要性，应详细地进行家系调查，了解患者双亲、同胞和近亲中是否有脑炎后遗症发作及其发作特点，对能引起智力低下和脑炎后遗症的一些严重遗传性疾病，应进行产前诊断或新生儿期过筛检查，以决定终止妊娠或早期进行治疗。
对于继发性脑炎后遗症应预防其明确的特殊病因，产前注意母体健康，减少感染、营养缺乏及各系统疾病，使胎儿少受不良影响。防止分娩意外，新生儿产伤是脑炎后遗症发病的重要原因之一，避免产伤对预防脑炎后遗症有重要意义。
如果能够定期给孕妇作检查，实行新法接生，及时处理难产，就可以避免或减少新生儿产伤。对于婴幼儿期的高热惊厥要给予足够重视，尽量避免惊厥发作，发作时应立即用药控制。对小儿中枢神经系统各种疾病要积极预防，及时治疗，减少后遗症。
一、抗病毒治疗：虽然目前尚无有效的抗病毒药物，但以下药物可以使用：碘甙(疱疹净)、三氮唑核苷(病毒唑)、丙种球蛋白，其他如转移因子，干扰素可以提高机体对病毒的抵抗能力，均可应用。
二、对症处理：
1、退热、止痉高热可以引起抽痉。
用物理降温或中、西药物退热。苯巴比妥或安定可预防或控制抽搐。
2、减轻脑水肿20%甘露醇。亦可用氢化可的松或地塞米松。
三、加强护理：病程中应加强护理，防止褥疮发生。要供给一定的水分、营养及电解质。对出现精神症状的病儿要防止发生意外。观察是否出现脑疝的先兆。
四、其他：其他系统受累时，如心肌炎、肺炎等应及时处理，病后遗留的后遗症可采用针灸、推拿、药物及训练等方法治疗。
脑炎后遗症的预后与病变的范围和病情的轻重有关。
脑部病变较局限且未侵犯"生命中枢"，病情较轻时，其预后往往良好。如昏迷持续时间较长，或有频繁惊厥时，脑部缺氧及病理变化加重，预后多较差，容易留有神经、精神的后遗症。某些病毒所致的脑炎预后较差，如西方马脑炎患儿常有后遗症，年龄愈小愈严重。
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