吃紧急避孕药的副作用多种多样，主要包括月经紊乱、内分泌失调、肠胃不适、子宫出血、不孕等。
1、月经紊乱。紧急避孕药里面含有大量的孕激素成分，紧急避孕药会短时间内迅速提高体内孕激素水平，抑制排卵；改变子宫颈黏液黏稠度，使精子不易穿透；增加子宫内膜厚度，从而阻止受精卵着床；或是改变子宫和输卵管的活动方式，阻碍受精卵的运送；从而达到避孕的效果。
期间因为避孕药影响了正常的内分泌性激素水平，扰乱了正常的月经周期，可能会导致月经不调，比如导致月经提前、月经延后、月经量多等情况。
2、内分泌失调。
紧急避孕药因为影响体内激素水平，还可以造成内分泌失调、失眠、体重增加，皮肤色素沉着及静脉血栓形成，部分患者还会出现轻度乳房触痛、头痛、眩晕、疲劳等症状。
3、肠胃不适。常用紧急避孕药有雌孕激素复方制剂、单孕激素制剂及抗孕激素制剂。
偶尔使用一次紧急避孕药后出现的副作用较少，症状也比较轻，通常在服药数小时后可能开始出现恶心、呕吐、食欲下降等肠胃不适症状，一般不需要特殊处理，症状通常在1~2天内会消失。
4、子宫出血。
服用紧急避孕药以后，由于体内激素水平的迅速波动，有可能导致异常子宫出血，但一般出血量较小，也能自行停止，无需特殊处理。
5、不孕。
如果长期服用紧急避孕药，比如一年内超过3次，还可能影响卵巢正常功能，干扰女性排卵，对女性身体和生殖系统产生不良影响，特别是可能损伤女性的子宫内膜，严重时会导致不孕，或者影响生育功能。
需要注意的是，紧急避孕药并不是100%避孕，由于不同避孕药的作用机理是多环节和多方面的，且因其所含成分、制剂、剂量和用法的不同而各异，加上药品质量可能不过关，所以存在避孕失败的可能。
建议服药后去医院检查。
由于紧急避孕药具有一定的副作用，因此只能紧急使用，不能当做长效避孕措施，长期避孕建议选择更为安全的避孕方式，比如使用避孕套，选择宫内节育器，做输卵管结扎术等。
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