肺脓肿在临床上分急性肺脓肿和慢性肺脓肿，起病可急可慢。早期症状和肺炎的症状相仿，主要包括发热、咳嗽、咳痰、盗汗、乏力等。病情严重的时候会出现呼吸衰竭的症状。有的病人体温升高到39℃-40℃，伴有高热、寒战、胸疼。
如果病变波及到胸膜腔，会引起疼痛，无法缓解。若呼吸衰竭，会出现呼吸急促。有的病人是厌氧菌感染，可出现痰中有腐臭味。这些病人就诊的时候可以先拍胸片，询问既往病史，比如有的病人酗酒、淋雨，还有拔牙病史，后出现急性发热，然后咳嗽、咳痰、胸痛。
此外还有一些卧床的病人，偶有意识不清，有时候会饮水呛咳、吸入饮食造成肺脓肿。
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