《药物化学》第6版是在第5版的基础上进行修订补充的，本版保持了第5版的格局及主要内容，对部分内容作了适当的调整，并加强了一些药物发展背景的介绍。本教材所介绍的药物尽可能包含以下内容：药物的名称、中英文化学名称、药物的理化特性；药物的化学结构、结构特征、基本药效结构及基团；药物的作用靶点（以细胞学及分子生物学为基点）、药物小分子与生物大分子之间的作用方式；药物的构效关系、药物的类似物及衍生物；药物在体内的化学转化过程；药物稳定性的化学基础；药物的发展历史及发展方向，其中特别关注新药设计及研究的各种创新性思路。
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