阴阳、五行学说是中国古代朴素的哲学思想，渗透到中医学中与中医学的固有理论和实践经验相结合，融为一体，成为中医学理论体系的重要组成部分。
它作为中医学特有的思维方法，一直用于阐释人体的组织结构、生理功能、病理变化，并指导着人类的养生和疾病的防治。
在中国古代，阴阳最初意义是指日光的向背，向日为阳，背日为阴。之后人们逐渐认识到很多的自然物象都有阴阳的性质和特点，如：天为阳，地为阴；男为阳，女为阴；昼为阳，夜为阴；暑为阳，寒为阴等等,后来便上升为一种哲学的理论，用于概括自然界相互关联的某些事物或现象，并含有对立统一的内涵。
人体的生命活动是以阴精和阳气为基础的，人体要维持正常的生命活动，必须有赖于体内阴阳两个方面保持相对的协调平衡，“阴平阳秘，精神乃治”“阴阳离决，精气乃绝”。
如果人体阴阳的协调平衡遭到破坏，出现偏盛或偏衰的局面，就会造成机体生命活动的失常而进入疾病状态。
中医学在指导临床治疗用药上，《素问》云：“谨察阴阳所在而调之，以平为期。”
即阴阳失调是疾病的基本病机，因而调整阴阳，使之保持或恢复相对平衡，达到阴平阳秘，是防治疾病的基本原则。
与阴阳学说相关的是五行学说。五行即木、火、土、金、水五种基本物质的运动变化。五行之间是相生相克的。其相生的顺序是木生火、火生土、土生金、金生水、水生木，循环往复，以至无穷；相克顺序是水克火、火克金、金克木、木克土、土克水，循环往复，以至无穷。只有生与克相辅相济，相互作用，才能维持整体平衡。
在中医学中，五行配属五脏（肝、心、脾、肺、肾）、五腑（胆、小肠、胃、大肠、膀胱）、五官（目、舌、口、鼻、耳）、五体（筋、脉、肉、皮、骨）、五志（怒、喜、思、悲、恐）、五味（酸、苦、甘、辛、咸）等，用此来阐释其相互间生克制化的生理病理关系，指导临床的诊断、治疗。
中医学理论根据五行生克关系，提出了一系列辨证施治的方法，诸如培土生金，滋水涵木、壮水制火等等。
人体五脏的生克关系正常与否，可以从人的色、声、味、脉等体象得到表征和反映，中医大夫可以通过五行的推演归类分析四诊（望、闻、问、切）收集的资料，以五行的生克乘侮理论来推断疾病的发生发展，防治疾病。
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