学校创建于1956年，由上海第一医学院（现复旦大学上海医学院）分迁来渝组建，原名重庆医学院，1985年更名为重庆医科大学。学校是国务院学位委员会批准的首批具有博士和硕士学位授予权的单位，是教育部批准的首批来华留学示范基地。学校2015年成为重庆市人民政府、国家卫生健康委员会（原国家卫生计生委）和教育部共建高校，2016年成为“高等学校学科创新引智计划”（“111计划”）首批立项的地方高校之一。
学校由位于渝中区的袁家岗校区和位于重庆大学城的缙云校区组成，校园总面积2650亩，其中缙云校区占地2100亩。校园环境优美，风景如画。
现有全日制在校学生25367人，其中博士、硕士研究生5961人，本科生18436人，留学生664人。学校具有招收博士后研究人员，港澳台学生和外国留学生资格。学校现有7个一级学科博士学位授权点、12个一级学科硕士学位授权点，3个博士专业学位授权点、10个硕士专业学位授权点；4个国家重点学科，6个进入ESI全球前1%的学科（2020年3月，科睿唯安发布），4个重庆市一流学科，12个重庆市“十三五”市级重点学科。在教育部学位中心第四轮学科评估中，临床医学等学科排名全国前列。
重庆医科大学教务管理系统入口：https://jwc.cqmu.edu.cn/
1、度一流本科专业建设点名单8个（国家级）
8个本科专业入选度国家级一流本科专业建设点：生物医学工程、临床医学、儿科学、口腔医学、预防医学、药学、医学检验技术、护理学。
2、国家特色专业
国家级特色专业：临床医学、医学检验、药学、护理学
3、其他重点专业
省级特色专业：临床医学、医学检验、预防医学、药学、口腔医学、护理学、麻醉学、医学影像学、中医学
省级“三特行 动计划”特色专业立项：临床医学、医学检验、预防医学、药学、口腔医学、护理学
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